Wilayah Kalurahan Jepitu termasuk satuan pegunungan seribu yang merupakan Kawasan perbukitan batu gamping dan membentang alam Karst yang tandus dan kekurangan air. Desa Jepitu terletak pada ketinggian yang bervariasi antara 250–300 meter di atas permukaan laut. Lahan di Kalurahan Jepitu mempunyai tingkat kemiringan yang bervariasi. Curah hujan rata-rata sebesar 1382 mm dengan jumlah hari hujan rata-rata 89 hari. Bulan basah 4–5 bulan, sedangkan bulan kering berkisar antara 7–8 bulan. Musim hujan dimulai pada bulan Oktober–Nopember dan berakhir pada bulan Maret– April setiap tahunnya. Puncak curah hujan dicapai pada bulan Desember – Pebruari.

Suhu udara rata-rata harian 25,5° C, suhu minimum 18,2°C dan suhu maksimum 33,4° C. Potensial untuk tanaman lahan kering (padi gogo dan palawija), tanaman buah-buahan (pisang, mangga, dll), budidaya perikanan perairan darat (telaga) dan perikanan laut serta untuk usaha ternak sapi dan kambing baik penggemukan maupun pembibitan.